穩(wěn)定同位素內(nèi)標(biāo)記化合物與對應(yīng)的未標(biāo)記化合結(jié)構(gòu)相似，所以理化性質(zhì)也極為相似，如果將穩(wěn)定同位素標(biāo)記物與對應(yīng)的未標(biāo)物用同樣的色譜方法檢測，其保留時間也幾乎一致，無法分辨。且穩(wěn)定同位素不具有放射性，無論在標(biāo)記化合物合成、分離提純及應(yīng)用過程中均無特殊防護要求，可作為內(nèi)標(biāo)用于臨床醫(yī)學(xué)研究及生物醫(yī)學(xué)、環(huán)境科學(xué)、食品檢測等諸多領(lǐng)域。

　　如何挑選穩(wěn)定同位素內(nèi)標(biāo)？

　　1、應(yīng)盡量選擇同位素豐度>98%以上的標(biāo)準(zhǔn)品。

　　2、如果選擇氘代產(chǎn)品作為內(nèi)標(biāo)，需選擇質(zhì)量差大于3(D3)以上的產(chǎn)品。

　　3、13C,15N通常標(biāo)記在分子的骨架結(jié)構(gòu)上，其標(biāo)記位點較為穩(wěn)定,氘代產(chǎn)品容易與液相流動相溶劑中的活潑氫發(fā)生交換，因此穩(wěn)定性不如13C,15N。如圖3，草甘膦如果用D標(biāo)記的話，羧基、亞氨基、羥基上面的D都屬于活潑位點，很容易脫離母體化合物，所以安譜實驗選擇13C,15N來進行標(biāo)記。另外考慮到氘標(biāo)記物的合成較為簡便，價格便宜，因此在氘標(biāo)記物能夠滿足實驗需求的情況下，也常選用氘標(biāo)記物作為內(nèi)標(biāo)物。

　　4、標(biāo)記位點還應(yīng)遠(yuǎn)離容易發(fā)生化學(xué)鍵斷裂的位置，以避開同位素效應(yīng)的影響。在質(zhì)譜中鄰苯二甲酸二甲酯的酯基容易斷裂，所以安譜實驗選擇氘標(biāo)記在苯環(huán)上。如果母體化合物因化學(xué)鍵斷裂同時生成2個重要子單元結(jié)構(gòu)化合物，可選擇雙標(biāo)記母體化合物。

　　穩(wěn)定同位素內(nèi)標(biāo)是質(zhì)譜方法，沒有別的臨床檢測方法用到同位素內(nèi)標(biāo)。比如光吸收和免疫的方法，都無法分辨出被檢測物和同位素內(nèi)標(biāo)的區(qū)別，因為它們的理化性質(zhì)太接近了。如果真的加進內(nèi)標(biāo)，那測出來的值肯定大大的偏高。只有質(zhì)譜才能把同位素內(nèi)標(biāo)和要檢測的物質(zhì)分得開，雖然它們的差別只有幾個道爾頓。現(xiàn)在的內(nèi)標(biāo)基本都是穩(wěn)定同位素標(biāo)記的，最常見的是D和13C。同位素內(nèi)標(biāo)和被檢測物是同一個物質(zhì)，但是其中的幾個氫原子被氘所取代，或者是12C換成了13C，理化性質(zhì)基本不變。